黃龍開始以小校跟隨大軍收複錦州，積功至參將。崇禎三年（1630年）又跟隨大軍收複灤州，居功第一，升任為副總兵。論功進秩三等，為都督僉事，世蔭副千戶。登萊巡撫孫元化因劉興治在東江鎮內訌，請黃龍前去鎮守。兵部尚書梁廷棟也推薦黃龍為總兵官。孫元化恢復四衛後，黃龍至皮島為東江總兵。

毛文龍死後，袁崇煥分其兵二萬八千為四協，各命副將陳繼盛，參將劉興治、毛承祚、徐敷負責。後改為兩協，陳繼盛領東協，劉興治攝西協。劉興治與陳繼盛不相協。劉興治之兄參將劉興祚陣亡，陳繼盛誤聽諜報，以為未死。劉興治為劉興祚治喪，諸將來弔喪。劉興治抓住陳繼盛和執理餉經歷劉應鶴等十一人。說陳繼盛誣劉興祚詐死，及以謀叛誣陷自己，于是殺陳繼盛及劉應鶴等。黃龍至皮島，劉興治桀驁如故。崇禎四年（1631年）三月作亂，杖其弟劉興基，殺參將沈世魁家眾。沈世魁率其黨夜襲殺劉興治。

游擊耿仲明之黨李梅被黃龍下獄。耿仲明弟弟都司耿仲裕在黃龍軍中，計劃作亂。十月，率部卒假稱索餉名圍黃龍衙署，擁至演武場，折大腿割去耳鼻，將要殺他。諸將將他救下。之後，黃龍捕斬耿仲裕。耿仲明與孔有德造反，崇禎五年（1632年）正月攻克登州，黃龍派尚可喜、金聲桓等撫定諸島。黃龍令游擊李維鸞和尚可喜等擊退高成友，即移駐旅順。冬天，孔有德等想要放棄登州入海，黃龍派遣副將龔正祥率水師四千在廟島截擊。颶風破舟，龔正祥被俘。後居登州，謀為內應。黃龍駐旅順大治兵，叛軍拘黃龍母親妻兒脅迫，黃龍不顧。

崇禎六年（1633年）二月，孔有德、耿仲明航海經旅順，被黃龍襲擊。黃龍率軍斬殺李九成子李應元，生擒毛承祿、蘇有功、陳光福及其黨高志祥等十六人，獲首級一千餘人，獻俘于朝。崇禎帝大喜，凌遲毛承祿等，傳首九邊，複黃龍之官。

孔有德投靠清朝皇太極。七月，偵知旅順空虛，于是引清兵來襲。黃龍屢戰皆敗，火藥矢石用盡，對部將譚應華說：「敵眾我寡，今夕城必破。如果快帶著我的大印送登州，不能到達，投入海中就行。」黃龍繼續力戰，最後自刎而死。崇禎贈黃龍左都督，賜祭葬，予世蔭，以副總兵沈世魁代黃龍為總兵官。