明朝都察院的長官為左右都御史（正二品），下設副都御史、僉都御史。清朝時都御史為從一品。

清崇德元年（1636年），皇太極即位後，清廷將監察文武百官的職責歸於都察院。

大清順治元年（1644年），清兵入關，都察院設左都御史、右都御史、左副都御史、右副都御史，負責糾察中國十五道、在京百官。

雍正元年（1723年）始，凡總督授加兵部尚書銜者，慣例兼都察院右都御史銜。不加尚書銜則一律加兵部右侍郎兼都察院右副都御史銜。