仁宗嘉佑六年（1061年）进士，调馀杭尉，转台州推官。神宗熙宁初年，力言新法不便，罢归故官。王安石罢相后，召为国子直讲。哲宗元佑初，召为秘书省校书郎。官至中书舍人。其弟孔武仲、孔平仲皆有文闻，合称「三孔」，黄庭坚称：「二苏联璧，三孔分鼎」之誉。元佑三年（1088年），举行贡举，还家而卒。《宋史》卷三四四有传。